Nisshin Shonin difundio sus enseñanzas e infringió la prohibición. En 1440, fue encarcelado como castigo por quebrantarla y su templo fue destruido. Continuó predicando incluso durante su encarcelamiento. Según la leyenda, durante su prisión, le pusieron una olla en la cabeza para que se callara. Se dice que ni siquiera una olla hirviendo pudo hacer que Nisshin dejara de predicar. Esta historia se conoce como el cuento del «santo de la olla» o, a veces, como «Nisshin de la olla».
En 1441, durante la era Kakitsu, tuvo lugar la rebelión Kakitsu . Esta rebelión culminó con el asesinato del sexto shōgun. Gracias a esto, Nisshin pudo escapar de su prisión y comenzó a reconstruir su templo Honpō-ji. Sin embargo, en 1460, Honpō-ji fue destruido una vez más. Esto se debió a que Nisshin continuó predicando a pesar de la prohibición previa sobre sus acciones. El templo fue destruido y Nisshin fue convocado a la capital por el octavo shōgun, Ashikaga Yoshimasa. Chiba Mototane escoltó a Nisshin hasta Kioto. Fue llevado a la residencia de Hosokawa Mochikata para ser encarcelado esta vez, torturado con agua y fuego, mas otras diversas torturas. Mientras estuvo encarcelado allí, conoció a Hon'ami Honkō (Kiyonobu), de la distinguida familia Hon'ami de expertos en espadas, quien se convirtió en su devoto seguidor. Ambos lograron ser liberados de su prisión gracias a la colaboración de los señores locales. Estos señores también realizaban frecuentes donaciones a Honpō-ji. Nisshin continuó predicando en Honpō-ji hasta su muerte en 1488, a la edad de 82 años.
